Academic Degree:

Doctor of Fisheries Sciences

Research Fields:

marine biology, planktonology, protistology

Academic & Professional Experience:

Apr. 2006－Mar. 2011: Agricultural Faculty, Hokkaido University (B.S.)
Aug. 2008－June. 2009: University of Strasbourg (as exchange student)
Apr. 2011－Dec. 2015: Graduate School of Fisheries Sciences, Hokkaido University (M.S. & Ph.D.)
Jan. 2016－Mar. 2016: Post-doc Researcher, Graduate School of Fisheries Sciences, Hokkaido University
Apr. 2016－Mar. 2017: Associate Researcher, Department of Botany, National Museum of Nature and Science
Apr. 2017－Mar. 2020: JSPS Research Fellow (PD), Department of Botany, National Museum of Nature and Science
Apr. 2020－present: Associate Researcher, Department of Botany, National Museum of Nature and Science
May. 2020－present: Assistant Professor, Estuary Reserach Center, Shimane University

Research Interests:

• Ecology and diversity of unicellular zooplankton (Phaeodaria and Radiolaria)
• Structure of estuary ecosystems

Academic Societies:

Japanese Society of Planktonology (日本プランクトン学会), Japanese Society of Protistology (日本原生生物学会), International Society of Protistologists (ISOP), Japanese Geoscience Union (JpGU), International Association of Radiolarists (InterRad)

Keywords:

Phaeodaria, Rhizaria, Radiolaria, unicellular zooplankton, community structure, DNA metabarcoding

Research Results:

I. Peer-reviewed papers

18) Nakamura, Y., Tuji, A., Kimoto, K., Yamaguchi, A., Hori, R.S., Suzuki, N.: Ecology, morphology, phylogeny and taxonomic revision of giant radiolarians, Orodaria ord. nov. (Radiolaria; Rhizaria; SAR). Protist,(2021.06)

17) Nakamura, Y., Tuji, A., Makino, W., Matsuzaki, S.S., Nagata, N., Nakagawa, M. and Takamura, N. (2020b) Feeding ecology of a mysid species, Neomysis awatschensis ― combining approach with microscopy, stable isotope analysis and DNA metabarcoding. Plankton and Benthos Research 15: 44–54.

16) Nakamura, Y., Sandin, M.M., Suzuki, N., Tuji, A., Not, F. (2020a) Phylogenetic revision of the order Entactinaria—Paleozoic relict Radiolaria (Rhizaria, SAR). Protist 171: 125712.

15) Gómez, F., Nakamura, Y., Artigas, L.F. (2019) Molecular phylogeny of the sand-dwelling dinoflagellate Planodinium striatum and Chrysodinium gen. nov. for Plagiodinium ballux (Dinophyceae). Acta Protozoologica 58: 115–124.

14) Nakamura, Y., Minemizu, R. and Saito, N. (2019) “Rhizarian rider” ― symbiosis between Phronimopsis spinifera Claus, 1879 (Amphipoda) and Aulosphaera sp. (Phaeodaria). Marine Biodiversity 49: 2193–2195.

13) Itagaki, H., Nakamura, Y. and T. Hosoya (2019) Two new records of ascomycetes from Japan, Pyrenopeziza protrusa and P. nervicola (Helotiales, Dermateaceae sensu lato). Mycoscience 60: 189–196.

12) Nakamura, Y., Iwata, I., Hori, R.S., Uchiyama, N., Tuji, A., Fujita, M.J., Honda, D. and Ohfuji, H. (2018b) Elemental composition and ultrafine structure of the skeleton in shell-bearing protists—A case study of phaeodarians and radiolarians. Journal of Structural Biology 204: 45–51.

11) Nakamura, Y., Somiya, R., Kanda, M., Yamaguchi, A., Tuji, A. and Hori, R.S. (2018a) Gazelletta kashiwaensis sp. nov. (Medusettidae, Phaeodaria, Cercozoa), Its Morphology, Phylogeny, Distribution and Feeding Behavior. Journal of Eukaryotic Microbiology 65: 923–927.

10) Zhang, L.L., Suzuki, N., Nakamura, Y. and Tuji, A. (2018) Modern shallow water radiolarians with photosynthetic microbiota in the western North Pacific. Marine Micropaleontology 138: 1–27.

9) 小林淳希・仲村康秀・宮下洋平・大洞裕貴・今井一郎．(2018) 渡島大沼において発生した溶藻性原生生物Asterocaelum sp.の乳白色ブルーム．陸水学雑誌 79: 109–117.

8) Shirouzu, T., Fukazawa, Y. and Nakamura Y. (2017) Femsjonia uniseptata (Dacrymycetes, Basidiomycota), a new species collected from Pinus densiflora forests in Japan. Phytotaxa 312: 271–278.

7) Nakamura, Y., Somitya, R., Suzuki, N., Hidaka-Umetsu, M., Yamaguchi, A. and Lindsay, D. J. (2017) Optics-based surveys of large unicellular zooplankton: a case study on radiolarians and phaeodarians. Plankton and Benthos Research 12: 95–103.

6) Nakamura, Y., Imai, I., Tuji, A. and Suzuki, N. (2016) A new phaeodarian species discovered from the Japan Sea Proper Water, Auloscena pleuroclada sp. nov. (Aulosphaeridae, Phaeosphaerida, Phaeodaria). Journal of Eukaryotic Microbiology 63: 271–274.

5) 仲村康秀・鈴木紀毅 (2015b) 海洋に広く分布する浮遊性原生生物，フェオダリア類の生物学（総説）．日本プランクトン学会報 62(2): 110–122.

4) Nakamura, Y. and Suzuki, N. (2015a) Chapter 9 Phaeodaria: diverse marine cercozoans of world-wide distribution. pp. 223–249. In: Marine Protists: Diversity and dynamics. (eds. Otsuka, S., Suzaki, T., Horiguchi, T., Suzuki, N. and Not, F.), Springer, Tokyo.

3) Nakamura, Y., Imai, I., Yamaguchi, A., Tuji, A., Not, F. and Suzuki, N. (2015) Molecular phylogeny of the widely distributed marine protists, Phaeodaria (Rhizaria, Cercozoa). Protist 166: 363–373.

2) Nakamura, Y. (2014) Differences in pollen resource usage and foraging periods between the exotic bumblebee Bombus terrestris and the native B. pseudobaicalensis and B. hypocrita sapporoensis in Hokkaido, Japan. Eurasian Journal of Forest Research 17: 1–10.

1) Nakamura, Y., Imai, I., Yamaguchi, A., Tuji, A. and Suzuki, N. (2013) An abundant zooplankton in the deep sea of the Sea of Japan: Aulographis japonica sp. nov. (Order Aulacanthida, Aulacanthidae), a new Phaeodaria species. Plankton and Benthos Research 8: 107–115.

II. Papers without peer review

9) 北橋倫・仲村康秀 (2019) 開催報告 2019年度日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会 自由集会「海洋生物研究と海洋ごみ問題―特にマイクロプラスチック研究にどう取り組んでいくか」．日本ベントス学会誌74: 129–135.

8) 仲村康秀 (2019) VIII ECOP-ISOP Joint Meeting参加報告．原生生物2(2): 6–7

7) 仲村康秀 (2019) 2019年日本プランクトン学会奨励賞を受賞して. 日本プランクトン学会報66(2): 113–114

6) 鈴木紀毅・仲村康秀 (2019) 放散虫やフェオダリアを利用する生物. 日本プランクトン学会報66(2): 104–105

5) 仲村康秀・松岡數充・今井一郎・石井健一郎・桑田晃・河地正伸・木元克典・鈴木紀毅・佐野雅美・José M. Landeira・宮本洋臣・西川淳・西田周平 (2019) プランクトンの分類・生態研究，その現状と最新知見．日本プランクトン学会報66(1): 22–40

4) 仲村康秀 (2019) 日本プランクトン学会秋季公開シンポジウム「プランクトン各分類群の最新知見 ― 多様性・群集構造解明のための分類学 ―」開催報告．日本プランクトン学会報66(1): 19–21

3) 仲村康秀 (2018) 日本プランクトン学会秋季公開シンポジウムII「単細胞動物プランクトン研究の最前線―フィールド調査に基づいた生態・多様性の解明―」開催報告．日本プランクトン学会報65(1): 12–13

2) 仲村康秀 (2017) 博士論文の要約と今後の展望．日本プランクトン学会報 64(2): 164–165

1) 仲村康秀 (2015) 九州沿岸におけるフェオダリア類・放散虫類の生態・系統関係調査．広島大学練習船「豊潮丸」航海報告書 No2015-05: 43–45

III. Translation (Japanese-French)

1. Nakamura, Y. (2015) Le Plancton : apprendre et comprendre en images, Station Biologique de Roscoff, 136 pp. (『ずかん プランクトン』(2011、技術評論社、136 pp.) の仏語版への翻訳)

IV. Books

2) 仲村康秀・鈴木紀毅 (2019) フェオダリア類・放散虫類の生態と共生生物、『海洋と生物』2019年8月号: 312–316

1) 仲村康秀 (2019) ガラスの殻を持つ未知のプランクトン ― 世界中のフェオダリアと放散虫を調べ尽くす ―、『自然と科学の情報誌 ミルシル』14: 9–11

V. Presentation in international symposia

17) Nakamura, Y., Kimoto, K., Suzuki, N., Hori, Ohfuji, H., Rie S. and Tuji, A. Skeletal structure and phylogeny of Phaeodaria (Cercozoa, Rhizaria). VIII ECOP-ISOP Joint meeting, Roma, Italy. (July 29, 2019)

16) Nakamura, Y., Hori, Rie S., Tuji, A., Ohfuji, H., Suzuki, N. and Kimoto, K. Structural difference between phaeodarians and radiolarians (unicellular zooplankton). JpGU2019, Chiba, Japan. (May 26, 2019) (招待講演)

15) Takano, E., Horii, S., Nakamura, Y. and Takahashi, K. Biomass and community composition of microzooplankton with reference to their nutritional mode in the North Pacific Ocean. PICES Annual Meeting 2018, BIO-P 13371, Yokohama, Japan (November 2, 2018)

14) Nakamura, Y. and Tuji, A. Ecological importance and new findings of phaeodarians and radiolarians in the North Pacific region. PICES Annual Meeting 2018, W1 13440, Yokohama, Japan (October 25, 2018)

13) Zhang., L. L., Suzuki, N., Nakamura, Y. and Tuji, A. Modern shallow water radiolarians with photosynthetic microbiota in the western North Pacific, Interrad 2017, O09-04, Niigata, Japan (October 26, 2017) (招待講演)

12) Nakamura, Y., Iwata, I., Somiya, R., Honda, D., Tuji, A., Suzuki, N., Hori, R. S. and Ohfuji, H. Ultrafine structure and molecular phylogeny of living radiolarians—with a view to clarifying the fossil phylogeny—, Interrad 2017, O03-03, Niigata, Japan (October 24, 2017) (招待講演)

11) Nakamura, Y., Somiya, R., Tuji, A., Lindsay, D. J., Ohfuji, H. and Hori, R. S. Cell division of phaeodarians―the first step to clarify the life cycle―, Interrad 2017, P17-03, Niigata, Japan (October 23–24, 2017)

10) Fujii, M., Hori, R. S., Nakamura, Y. and Ohfuji, H. A study on chemical composition of living acantharian (Radiolaria) shell. Interrad 2017, P17-01, Niigata, Japan (October 23–24, 2017)

9) Kakumu, A., Nakamura, Y., Morita, K., Ako, N., Kodama, I. and Imai, I. Detection of warm-water HAB flagellates in coastal water of Tsugaru Channel, Hokkaido. 10th EASTHAB Symposium, No. 06, Hakodate, Japan (December 4, 2017)

8) Nakamura, Y., Somiya, R., Suzuki, N., Hori S., R. and Tuji, A., Phylogeny and ecological importance of phaeodarians (Cercozoa, Rhizaria), Protist-2016, session 7B-5, Moscow, Russia (June 9, 2016)

7) Nakamura, Y., Somiya, R., Tuji, A., Suzuki, N. and Hori S., R., Ecology and diversity of phaeodarians (unicellular zooplankton) around Japan, JpGU 2016, MIS-13-10, Chiba, Japan (May 23, 2016)

6) Nakamura, Y., Imai, I., Not, F., Tuji, A. and Suzuki, N., Morpho-genetic phylogeny and distribution pattern of phaeodarians (Cercozoa), Interrad 2015, Oral Session 9 No. 4, Antalya, Turkey (March 26, 2015)

5) Nakamura, Y., Yamaguchi, A., Suzuki, N., Tuji, A. and Imai, I., Comparison of stable isotope ratios between zooplankton communities around Japan, 2014 Ocean Sciences Meeting, no. 2854, Honolulu, USA (February 27, 2014)

4) Nakamura, Y., Yamaguchi, A. and Suzuki, N., Characteristics of zooplankton community in the Japan Sea: biomass, stable isotope ratio and dominant taxa, PICES 2012 Annual meeting, W2 No. 7, International Conference Center, Hiroshima, Japan (October 12, 2012)

3) Nakamura, Y., Yamaguchi, A. and Suzuki, N., Food web structures of zooplankton communities and the vertical distribution of Phaeodaria, Future Direction of Biological and Paleontological Radiolarian Studies between Japan and France, Motobu-Resort Hotel, Okinawa, Japan (December 4, 2011)

2) Suzuki, N., Tuji, A., Ogane, K., Nakamura, Y., Yamaguchi, A. and Aita, Y., Why does the phylogenetic tree of Radiolaria look attractive? -In a view of morphological evolutionary classification, Japanese-French Mini-Symposium on Marine Plankton, NIES, Tsukuba, Japan (December 1, 2011)

1) Nakamura, Y., Clarification of food web structures in lakes and seas, IFES-GCOE Laboratory Short Course on Stable Isotopes, No. 3, Graduate school of Environment Earth Science, Hokkaido University, Sapporo, Japan (November 2, 2011)

VI. Organization of symposia and exhibitions

9) 企画展の企画・運営、Seed of Life (生命の実)、KYOTO STEAM ―世界文化交流祭― 2020、京都市京セラ美術館、2020年4月 (新型コロナウイルス感染拡大のため開催中止)

8) 企画責任者、日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同自由集会「海洋生物研究と海洋ごみ問題―特にマイクロプラスチック研究にどう取り組んでいくか」、日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会、静岡市産学交流センター、2019年9月

7) 企画責任者、日本プランクトン学会秋季公開シンポジウム「プランクトン各分類群の最新知見 ― 多様性・群集構造解明のための分類学 ―」、日本プランクトン学会、創価大学、2018年9月

6) 企画責任者、日本プランクトン学会秋季公開シンポジウムII「単細胞動物プランクトン研究の最前線―フィールド調査に基づいた生態・多様性の解明―」、日本プランクトン学会、滋賀県立大学、2017年9月

5) 実行委員、日本プランクトン学会若手の会集会2019、日本プランクトン学会、静岡市産学交流センター、2019年9月

4) 実行委員、日本プランクトン学会若手の会集会2018、日本プランクトン学会、創価大学、2018年9月

3) 実行委員、日本プランクトン学会若手の会集会2017、日本プランクトン学会、滋賀県立大学、2017年9月

2) 実行委員、日本プランクトン学会若手の会集会2016、日本プランクトン学会、熊本県立大学、2016年9月

1) 実行委員、Mini-symposium: Study on morpho-molecular diversity assessment of ecologically, evolutionally and geologically relevant marine plankton (Radiolaria)、北海道大学、2013年8月

VII. Awards

5) 2019年日本プランクトン学会奨励賞 (研究課題名：フェオダリア類・放散虫類の分布生態および遺伝的多様性の解明) (2019年3月)

4) InterRad 2017 (国際放散虫研究集会) Best Presentation Award for Young Scientist (poster presentation) (2017年11月)

3) 2015年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会 学生優秀発表賞 (口頭発表) (2015年9月)

2) 第47回日本原生生物学会大会 ベストプレゼンテーション賞 (口頭発表) (2014年10月)

1) 平成25年度日本プランクトン学会 論文賞 (2013年3月)